A Assembléia Geral é composta por um representante de cada associado que elegem o seu presidente. Já o Conselho executivo é formado por indicação dos associados e acompanha o desempenho e funcionamento do CTDUT, indicando um de seus membros para a função de presidente do CTDUT. O CTDUT é dirigido pelo Gerente Executivo, que é o responsável pela gestão e condução do centro.

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